Лляне насіння може викликати алергічну реакцію. Тому пробувати продукт уперше, слід з обережністю. Також важливо пам'ятати, що при порушеннях умов зберігання в насінні льону накопичується синильна кислота – речовина, яка при взаємодії з калієм утворює отруту.