Збирати сировину змієголовника можна протягом усього періоду росту рослини. Для різних цілей збирають його і у фазі бутонізації, і після цвітіння та в період появи молодих пагонів. У лікарських цілях найбільш придатна сама рослина, до її цвітіння. Це молоді стебла, листя та пагони.