Коренева система томату залежить від особливостей вирощування та сорту самого продукту. За певних умов, у сильнорослих сортів вона досягає 1,5-2,5 м у діаметрі та 1-1,5 м у глибину. На стеблі томату в будь-якому місці при створенні оптимальних умов (висока вологість повітря та ґрунту) з'являються придаткові корені.